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- Biblioteca Joaquín García Monge
- Biblioteca Campus Liberia
- Biblioteca Campus Nicoya
- Biblioteca Campus Coto
- Biblioteca Pérez Zeledón
- Biblioteca Sección Regional Sarapiquí
- Biblioteca Sede Interuniversitaria
- Centro de Documentación del CINPE (CINPE-DOC)
- Biblioteca Escuela del Movimiento Humano
- Biblioteca Escuela Medicina Veterinaria
- Biblioteca Centro de Información Documental de Ciencias Sociales
- Biblioteca Centro de Estudios Generales
- Biblioteca Especializada en Relaciones Internacionales
- Biblioteca Facultad de la Tierra y el Mar
- Biblioteca Facultad Exactas y Naturales
- Biblioteca Facultad Filosofía y Letras
- Centro de Documentación e Información Especializado en Recursos Hídricos y Cambio Climático
- Biblioteca Especialidad en Educación del CIDE
- Sistema de Información para las Artes